在山本拓和小蘭在伊豆海灘破完案子后開始享受假期的時候，柯南醒過來發現自己在一個殘破的廚房里，身上還被纏著繩子。
“頭好暈啊…可惡！對我下了什么迷藥…”柯南搖搖頭不忿道。
柯南站起身來，四處瞅瞅，發現有個窗戶就走了過去，從窗戶向外看去，發現自己身處在一間舊房子的二樓。
“什么？里還沒有宰了他？”
“你不要逼我！上面明明說不能殺他的……”
柯南在想辦法的時候，門外傳來男女爭吵的聲音。
柯南走過去透過門上破洞看去，發現那個綁架她的女人和一個穿披風戴高帽的男人。
“不管怎樣，他是吃了那種藥產生的副作用的特例，應該將他帶回組織調查！”那個自稱文代的胖女人說道。
“真麻煩！這樣我們還得設法帶他去組織。”穿披風的男人不爽的說道。
看著門后兩人的爭吵，柯南心中想到：“原來如此……怪不得只是將我帶到這里不殺我，不過那個男人是誰？”
正在柯南想著的時候，那男人轉過身來，然而那男人還帶著可怕的面具，他似乎察覺到不對，緩緩的朝門走來。
柯南迅速裝死，那男人透過剛才柯南看門洞向里看去，文代在旁邊問道：“那小鬼醒了嗎？”
“還沒，睡到正香甜呢……藥效似乎還沒退……”那男子看著還倒在地上柯南說道，“不過，他真的是工藤新一嗎？怎么看都不像啊……”
“是啊，我也還無法完全確定……”叫文代的女人說道，“可是在工藤新一失蹤之后，那小鬼就跟著出現在偵探事務所……而且自從他出現后，事務所的辦案效率就是莫名其妙地提高了許多……再從他白天逃跑的敏捷身手看來……怎么看都像工藤新一本人！！他一定是喝了組織新研究的毒藥，才變小的……”
“喔……你是說當時組織為了滅口而強灌他的那個藥啊……但是，那不是殺人毒藥嗎？”面具男說道。
“所以說啊，我還是不太能相信那藥能使人變小……”文代附和說道。
“不然我們就來做個試驗吧！”面具男提議道。
“什么試驗？”文代好奇的問道。
“組織也有配合我一模一樣的毒藥…”面具男拿出一盒藥說道，“只要把這藥給別人試試，就可以知道它到底會不會使人縮小！”
“好是好…但是要找誰呢？”文代有些意動。
“哼哼…就找明天那筆交易的對象…組織要我們等交易結束就馬上解決掉那個人…反正他早晚都死…”面具男冷酷的說道。
“可是，萬一這藥真的能讓人變小，那又怎么辦？”文代疑問道。
“這還不簡單！先當場宰了那家伙…然后，再回頭來收拾這小鬼！！”面具男冰冷的說道。
“等等！上級不是說這小鬼是此藥產生副作用的特例，叫我們要活捉回去化驗嗎？”文代疑惑道。
“知道組織秘密的人怎么能讓他活著！？”面具男冷酷的說著，“反正早晚都是要解剖，活的死的還不是一樣！？到時上級若追問下來，就說是為了防止他逃走，開槍射殺的就好了！”
“可，可是”文代還早爭辯，面具男的槍就瞄準了她，只聽面具男冰冷的說道：“少啰嗦！這就是我的做法！在啰里八嗦的話…我就一槍斃了你！！”
“我，我明白了…”文代留著冷汗說道。
“你聯絡他明天交易的地點了沒？”面具男收起槍問道。
“聯絡了，用老辦法…”文代回答道。
“嗯，交易時間是下午一點整，晚上好好休息吧。”面具男說道。
看來等了好久聽門外沒有聲音了，就起來從門洞向外看去，發現那兩個人都睡著了。
柯南，覺得是他脫身的機會。于是就四處尋找能割開繩子的東西。終于在櫥柜里發現了一瓶紅酒。于是他用布把酒瓶包住，然后用腳的往地下一磕，酒瓶就碎了。
不過還是出了點意外，發出了一聲“磅”的聲音。柯南暗叫糟糕，起身回到門洞向外看去，發現沒吵醒他們，放下心來，回去拿起酒瓶的碎片將繩子割斷。
解開束縛后，柯南開始尋找逃跑路線，發現唯一可行的出路被那兩人堵住了。
就在柯南啊焦急的不知道該怎么辦的時候，他聽到了滴答滴答的聲音。循聲走過去。發現是那瓶紅酒碎了后，紅酒滲透地板的聲音，由此他發現了一個財務室，想到一個好辦法。
第二天早上，找書苑 wｗｗ.zhａosｈuｙuan．ｃom 當那兩個人發現柯南不見了之后，面具男認為柯南還在房間里，就尋找了一番沒有找到，因為交易的時間快到了，最后他用槍掃射一番和文代開車走了。
在面具男和文代離開之后，柯南從藏匿的財務室走了出來，拍怕胸脯，讓自己從剛才槍聲中緩過神來，就準備去找毒藥。
仔細的找了許久，并沒有找到他要找到毒藥，反而很意外的找到了他的手機，同時還從舊報紙和日歷的線索中知道了那些人今天交易的地點在米花豪華飯店。
于是他準備去那里跟蹤他們的交易，不過在此之前他準備給阿笠博士打個電話。
“嘟嘟嘟…”一聲聲的忙音，讓柯南的心沉了下來，這已經是他第三遍發給阿笠博士電話了，可是都沒有人接。
柯南有一種不好的預感，顫抖給小蘭打電話……
半個小時后，“混蛋，你倒是接電話呀！你不是很厲害的嘛！為什么不接電話…”柯南留著淚咆哮道。
柯南已經給小蘭打了n個電話都沒人接，打事務所的電話也沒人接，甚至還給目暮打了電話也沒人接。無奈之下，他給山本拓打了電話，可是依然沒人接。
柯南害怕了，懊悔了。
“都是我，一定是我沒跟他們講清楚，他們沒有防備之下才會這樣…”柯南留著淚自責道………
發泄了許久，柯南才慢慢的平復下來，再抬起頭時，眼中已經是滿滿的堅定。
“小蘭，你等我，我一定會把你救出來…哪怕和他們同歸于盡。”柯南走出大門心中如是想到……
